东京都于2026年9月17日宣布，流感疫情已达到“注意报”级别。本季全国范围内的流行时间较往年提前，东京都内超过“注意报”标准的时点也比去年提前了一个多月。鉴于即将迎来长假，疫情可能进一步扩大，因此呼吁民众做好防疫工作。
东京都将东京都内419家定点医疗机构报告的流感患者人数按保健所为单位进行统计，当管辖范围内每家定点医疗机构的患者人数超过10人时发布“注意报”，超过30人时发布“警报”。当整个东京都超过预警或警报启动标准值，或者处于预警或警报级别的各保健所辖区内人口总和超过东京都总人口的30%时，将认定为大范围流行已发生并持续，并发布预警或警报。
东京都2026年第37周（9月7日～13日）每家定点医疗机构报告的患者人数为9.53人。在31个保健所中，有14个保健所的每定点报告病例数达到预警级别，处于预警级别的保健所辖区内人口比例达到东京都总人口的47.87%，超过了预警标准。
每定点报告病例数超过10人的保健所，按报告数从高到低依次为：町田市（17.31人）、荒川区（13.71人）、北区（13.45人）、江东区（13.43人）、中野区（13.40人）、文京区（12.86人）、涩谷区（12.71人）、多摩府中区（11.55人）、丰岛区（11.38人）、江户川区（10.68人）、台东区（10.57人）、板桥区（10.56人）、练马区（10.52人）、多摩小平区（10.48人）。
8月31日至9月13日期间，东京都内学校及福利设施等处发生的流感样疾病集体感染案例共计225起。其中，东京都内保育所、幼儿园、小学、初中、高中等机构实施的临时停课（如班级停课等）共计107起，按学校类型划分，小学以88起居首。
流感病毒检测情况（流感样疾病群体病例）显示，2009年作为新型流感流行过的“AH1pdm09型”占85.7%。
东京都方面提醒，随着长假临近，预计今后人员流动和接触机会将增加，疫情可能进一步扩大。呼吁民众务必做好勤洗手、消毒、通风、遵守咳嗽礼仪以及接种疫苗等基本的感染预防措施。
