长崎大学于2026年6月10日宣布，发现2026年度（令和8年度）一般选拔（前期日程）的录取判定存在错误。部分考生的大学入学共通测试成绩未被计入判定。经重新进行录取判定，追加录取1名考生。
6月1日，有2026年度新生指出“参加全国大学入学统一考试的特定必修科目成绩未反映在成绩公布中”，由此发现该问题。校方于当天核实情况后发现，针对特定考号区间的考生，在未将共通测试必修科目分数计入总分的情况下进行了录取判定。
据该校称，自2026年度入学考试起，前期日程的考生编号分配规则已发生变更，系统供应商据此修改了分数统计程序。在系统供应商修改程序时，部分考生编号区段的设置导致共同测试的必修科目未被计入总分。据悉，无论是招生科的计分过程核查，还是各学院进行录取判定时，均未能发现该错误，最终导致了此次事件的发生。
相关学院重新进行录取判定后，发现原本被判定为不合格的考生中，有1人符合录取条件，因此将其列为追加录取。其他考生的录取结果未受影响。校方已对2026年度入学考试起更改了考生编号规则的所有院系及选拔类别进行了排查，确认未发生同类事件。
已于6月3日向追加录取者寄送正式录取通知书。同时，校方相关人员亲自登门，当面致歉并说明了失误经过。此外，应追加合格者及其家属的要求，其所属学部名称等信息不予公开。
今后将成立防止再发研讨委员会，推进对原因的彻底分析及制定切实有效的防止再发对策。具体而言，将对招生科与系统供应商之间的变更确认流程等进行核查，并着手修订作业及确认手册。校方表示，不仅要提高警惕，还将从根本上重新审视确认机制本身，致力于防止事态重演并真诚地应对考生。
长崎大学针对此次事件发表评论称：“在理应公正且准确的入学考试中发生此类状况，给考生及相关人士造成了极大的困扰和担忧，我们对此深表歉意。”
